La Comisión Nacional Electoral esta integrada por quince miembros titulares e igual número de suplentes y es electa en la misma oportunidad en que se realiza la elección del Comité Ejecutivo Nacional. Para ser integrante de la Comisión Nacional Electoral no se exige la calidad de convencional.
Tiene las siguientes competencias: cumplir y hacer cumplir la Carta Orgánica y las resoluciones de los órganos competentes del Partido en materia electoral; asesorar al Comité Ejecutivo Nacional en todo lo referente a los temas electorales; coordinar todas las tareas relacionadas con los actos y procedimientos electorales en los que participe el Partido; analizar y promover ante el Comité Ejecutivo Nacional todas las solicitudes de reconocimiento, autorización y registro electoral presentadas por las agrupaciones partidarias, tanto de carácter nacional como departamental; llevar el padrón de afiliados y adherentes al Partido Colorado; llevar el Registro Único de Agrupaciones, tanto de carácter nacional como departamental, del Partido Colorado; llevar el padrón de la Convención Nacional y de todos los demás órganos de carácter nacional; supervisar las elecciones de segundo grado que se realicen en el Partido; supervisar a las Comisiones Electorales Departamentales y colaborar con ellas para el mejor desarrollo de las tareas de su competencia; promover la inscripción cívica; promover la creación de un ámbito que reúna a los funcionaros electorales de filiación colorada y coordinar sus actividades; y rendir informe de su gestión al Comité Ejecutivo Nacional toda vez que le sea requerido.

Sebastián Bonilla
PRESIDENTE DE LA COMISIÓN
VICEPRESIDENTE
Mónica Álvarez
SECRETARIO
Enzo Bentancourt
Natalia NOGUEIRA
Luis FERRARI
Gerardo TAPIE
Daniel DRINFELD
Santiago MARANDINO
Miguel ROMERO
Ximena GRIGNOLi
Jorge GOMEZ
Leandro ORTEGA
Rosa PREDROSA
Rossana VANNI
Verónica FABRICIO